Sebagaimana Rencana Pembangunan Pendidikan Jangka Panjang Nasional (RPPJPN) (2005-2025) yang disusun oleh Kementerian Pendidikan Nasional bahwa rencana pembangunan disusun ke dalam empat tahapan tema pembangunan, yaitu tahap 2005-2010 yang berfokus pada peningkatan kapasitas dan modernisasi, tahap 2010-2015 yang berfokus pada penguatan pelayanan, tahap 2015-2020 yang berfokus pada penguatan daya saing regional, dan tahap 2020-2025 yang berfokus penguatan daya saing internasional. Oleh karena itu, UHO menetapkan visi jangka panjang hingga tahun 2045 sebagaimana yang tercantum dalam Rencana Induk Pengembangan (RIP) UHO 2012- 2045, yakni: “Menjadi Perguruan Tinggi Kelas Dunia dalam Pengelolaan dan Pengembangan Wilayah Pesisir, Kelautan, dan Perdesaan pada Tahun 2045”
Dengan mengacu pada visi UHO, visi FMIPA UHO Tahun 2020-2024 adalah :
Dan visi jurusan/program studi sebagai berikut:
Pada tahun 2028 menjadi Program Studi yang Unggul dalam menghasilkan lulusan yang berkarakter mulia, mampu mengembangkan ilmu kimia dan terapannya dengan pendekatan inter dan multidisipliner berbasis potensi kelautan dan perdesaan yang berwawasan lingkungan
